无论东条英机怎样抵赖，远东国际军事法庭最终认定他犯有５４项罪状，仅在“破坏和平罪”一类中，他就犯有对华实行侵略战争、对美实行侵略战争、对英实行侵略战争、对荷兰实行侵略战争、对法实行侵略战争、１８年间一贯为控制东亚及太平洋进行阴谋活动等６项罪行。《判决书》指出：“东条在１９３７年６月任关东军参谋长，自此以后，几乎所有的阴谋活动，他都以首谋者之一而与他人互相勾结。”“他对于日本邻邦的犯罪攻击，负有主要责任。”　　

　　１９４８年１１月４日，远东国际军事法庭宣布判决。东京国际军事法庭自１９４６年５月开庭，至１９４８年１２月执行判决，审判持续两年半之久，公开庭审８１８次、秘审１３１次，受理各类文件证据４３３６件，证人证词１１９４件。法庭在公审庭上作出了５６件裁定，在法官内部会议上作出了１７５件裁定。审判记录共计４８４１２页。　　

　　判决书长达１２３１页，达几十万字，一共宣读了７天，直到１９４８年１１月１２日才读完。　　

　　判决书确认日本的内外政策在受审查的时期（１９２８—１９４５）内都是旨在准备和发动侵略战争，而被告的２５人都犯有严重的战争罪行（２８名甲级战犯中，因松冈洋右与永野修身已染疾而亡、大川周明“发疯”，法庭中止了对他们的审判）。　　

　　由于远东国际军事法庭没有制定统一的量刑根据，来自不同国家的１１名法官各自援引本国的法律条款，因此，在对这些战犯量刑时产生了严重的分歧。尤其对于死刑，分歧更大，那些已经废除死刑国家的法官自然不赞成此种刑罚。庭长韦勃根据澳大利亚的刑罚条文，主张把战犯们流放到荒岛上去；印度的法官帕尔信奉佛教，主张“世人需以宽宏、谅解、慈悲为怀，不应该以正义的名义来实施报复”，竟然要无罪开释全体战犯。经过激烈的争论、磋商，最后以６票赞成、５票反对，通过了对东条英机、坂垣征四郎、土肥原贤二、松井石根、广田弘毅、木村兵太郎及武藤章７人处以死刑的判决。　　

　　远东国际法庭判处木户幸一、平沼骐一郎、贺屋兴宣、坞田繁太郎、白鸟敏夫、大岛浩、荒木贞夫、星野直树、小矶国昭、畑俊六、梅津美治郎、南次郎、铃木贞一、佐藤贤了、桥本欣五郎、冈敬纯１６人无期徒刑，判处东乡茂德２０年有期徒刑，重光葵７年有期徒刑。　　

　　梅津美治郎是日本陆军中有名的死硬派，在任天津驻屯军司令官期间故意制造事端，用武力逼迫中国签订《何梅协定》。接替东条英机出任参谋总长后，指挥过日军在中国的桂柳会战、老河口战役及芷江战役，并指挥过冲绳战役等太平洋战场的诸战事；走投无路之际还拒绝投降。两任首相平沼骐一郎和小矶国昭都是实行侵略战争的魁首，平沼是法西斯组织“国本社”的头目，被公认为“日本法西斯之父”；小矶曾参与操纵建立伪满洲国，支持全面对华侵略战争和太平洋战争。木户幸一擅长权术，是天皇的宠臣，任文部大臣时费尽心思地推行军国主义教育；他激赞东条英机“手腕强硬”，在他的力荐下，东条英机得势，点燃了太平洋战火。佐藤贤了、冈敬纯和坞田繁太郎均是东条英机的得力幕僚，鼓吹进行太平洋战争并指挥作战，还犯下了虐待俘虏的罪行。重光葵、大岛浩、白鸟敏夫和东乡茂德则都是法西斯化的外交官，不择手段地粉饰侵略行径，缔结法西斯联盟，推行阴谋外交，不遗余力地为侵略战争卖命。他们都犯下过天诛地灭的罪行，受到了应有的惩罚。　　

　　１９４８年圣诞前夕，丧钟终于为战犯鸣响，７名战犯被处决。　　

　　疯狂嗜血的战犯终于受到了正义的惩罚。　　

　　远东国际军事法庭对日本主要战犯的审判具有重大的历史意义：第一，它正式判定了日本从九一八事变到太平洋战争期间所进行的战争是侵略战争，明确了日本发动的战争的犯罪性质，而且是最大的国际性犯罪，是全部罪恶的集大成者。第二，通过这次审判，核实了大量史实，揭发和列举了战争贩子们的战争罪行，并惩办了战争的策划者。它以审判战犯的形式说明：一切计划和准备侵略战争的行为和参与者都要负刑事责任。这对于藏在幕后预谋和策动战争的战争贩子是一个威慑、一个警告。第三，它判定了违反人道罪，即“战时或战前对　　

　　非武装人民的屠杀、灭种、奴役、放逐及其他不人道的行为，或基于政治的、人种的或宗教的理由而施加的迫害”，都是犯罪行为。这就使得为了战争而发生在战争之前或发生在其本国的犯罪，也同样逃脱不了国际正义的惩戒。第四，这次大审判以实践的方式，把以往的国际公约加以发展，并以法律的形式予以固定，成为国际上确认战争责任、惩治战争罪犯的普遍准则，这对于反对侵略，防止战争、维护和平有着更加深远的意义。第五，通过对主要战犯的审判，严惩了丧心病狂、罪大恶极的战争元凶，伸张了国际正义，抚慰和鼓舞了各国人民，为死难者复仇雪恨，这无论从法律还是从道义上讲，无疑都是必需的、正当的，是符合各国爱好和平的人民的愿望和要求的。因此，东京审判是一次正义的审判，一次大快人心的审判。　　

　　但是，由于美国对日本的单独占领，美国在东京的审判中起到了主导作用，法庭的组织、法官的任命、战犯名单的确定均由麦克阿瑟定夺。作为战胜国之一，作为时代普遍声音的幕前人物，美国部分地反映了千百万人的意愿，保证了东京审判的进行，并象征性地处罚了部分罪大恶极的战犯。正因为是象征性的，所以就有了选择性。出于愈演愈烈的冷战需要，也是出于麦克阿瑟的一己好恶，美国从一开始就把惩治的锋芒对准与美国交战直接相关的战犯，别的战犯能从轻发落就从轻发落。而对于能为其所用的战犯，哪怕是罪恶昭彰，也不惜代价地予以庇护。