在谎言被揭穿后，松井石根使出了第三招——推卸责任。他先是说南京大屠杀应该由日本皇室的朝香宫亲王负责，接着说他采取了一些措施加以制止。检察官问他：“那么你采取的究竟是些什么措施呢？”　　

　　“我出过一张整饬军纪的布告，贴在一座寺庙的门口。”　　

　　“你以为在浩大的南京城内，日军杀人如麻，每天有成千成万的男女被屠杀和强奸，你的一张布告会有什么效力吗？”　　

　　松井语塞。他想了想，说：“我还派了宪兵维持秩序。”　　

　　“多少宪兵？”　　

　　“记不清了，大约有几十名。”　　

　　“你以为在几万日军到处疯狂地杀人、放火、强奸、抢劫的情况下，这样少数的宪兵能起到制止的作用吗？”　　

　　松井又想了想，说：“我想能够。”　　

　　当证人证实当时南京只有１７名宪兵，这些宪兵本身也参加了暴行时，松井再也无法为自己开脱。　　

　　后来，松井石根在巢鸭监狱曾向僧人花山信胜忏悔：“南京事件，可耻之极。”　　

　　远东国际军事法庭根据大量的人证、物证，确认南京大屠杀是现代战争史上破天荒之残暴纪录。《判决书》认定日军在南京实施了惨无人道的暴行：　　

　　“日军在占领南京后，至少有六个礼拜，包括松井和武藤章（松井石根的参谋长）入城后的至少四个礼拜，一直不断地在大规模地进行着大屠杀。”　　

　　“全城中无论是年轻的少女或老年的妇人，多数都被奸污了。并且在这种强奸中，还有许多变态的和淫虐狂行为的事例。许多妇女在遭强暴后被杀，躯体被斩断。”　　

　　“日军仅于占领南京后最初的六个星期内，不算大量抛江焚毁的尸体，即屠杀了平民和俘虏２０万人以上。”（实际日军在南京残酷屠杀３０多万人。）　　

　　松井石根纵容了暴行：“当这些恐怖的突发事件达到最高潮时，即１２月１７日，松井进南京城并曾停留了五至七天左右。根据他本身的观察和参谋的报告，他理应知道发生了什么事情。他自己承认曾从宪兵队和使、领馆人员处听说过他的军队有某种程度的非法行为。在南京的日本外交代表每天收到关于此类暴行的报告，他们并将这些事报告给东京。本法庭认为有充分证据证明松井知道发生了什么样的事情。对于这些恐怖行为，他置若罔闻，或没有采取有效办法来缓和它。”　　

　　没有根据证实松井由于生病而无法实施制止暴行的愿望：　　

　　“他的疾病既没有阻碍他指挥在他指导下的作战行动，又没有阻碍他在发生这类暴行时访问该市区达数日之久。而对于这类暴行具有责任的军队又是属他指挥的。他是知道这类暴行的。他既有义务也有权力统治自己的军队和保护南京的不幸市民。由于他怠忽这些义务的履行，不能不认为他负有犯罪责任。”　　

　　法庭庄严宣告：“被告松井石根，根据起诉书中判决为有罪的罪状，远东国际军事法庭处你以绞刑。”　　

　　武藤章被认定犯有参与策划发动侵略战争、制造南京大屠杀和马尼拉惨案等多项罪行，也被判处绞刑。　　

　　东条英机以其残酷和强悍而有“剃刀将军”的恶称。在法庭上，他千方百计回避自己是主要决策者的事实，推脱责任，否认侵略活动。　　

　　东条狡辩说：“大东亚共荣圈”不是侵略，日本对外战争是“自卫自存”，是为了“解放东亚民族”。　　

　　法官质问道：“杀戮２００万以上的中国人，都是出于自卫的考虑吗？”东条无言以对。　　

　　法官问他：“你是否承认犯有发动战争罪？”　　

　　东条：“这次战争实在是日本的自卫战争！”　　

　　法官：“１９４２年的‘巴塔安死亡行军’，强迫战俘在酷热的气候中长途跋涉，大批被弄得精疲力竭的俘虏在‘行军’中遭到毒打、刺杀和枪杀。对此你负有什么责任？”　　

　　东条：“按照日本的习惯，执行特定任务的司令官不受东京具体命令的约束，享有相当大的独立性。”　　

　　法官：“据我们所知，经日本最高当局批准，强迫战俘在恶劣的条件下用双手修建泰缅铁路，路基两旁遗下成千上万战俘的白骨，是这样的吗？”　　

　　东条：“我们没料到会做出这样的事来。按日本人的性格，他们相信无论天上还是地下都不能容忍犯下这种罪行。”　　

　　东条英机否认他下令发动太平洋战争的责任。检察官对此进行了严厉的反驳，揭露他在日本和美国在开战前的谈判中，指示日本外交部制定了迷惑美国的两套谈判方案。１９４１年１１月５日，日本政府指示驻美大使，分次向美国提出两案，敷衍美国人。据此，１１月７日，日本大使向美国递交甲案；两个星期后，递交乙案。虽然被美国拒绝，但为取得偷袭的最佳效果，仍旧与美国继续周旋。　　

　　事实证明，东条英机是发动太平洋战争的罪魁祸首。